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■PHP5.3.3のセキュリティ
CentOS6では、未だにデフォルトでPHP5.3が入る件について
RHEL/CentOS 6のPHP5.3.3 は安全か？
http://qiita.com/nanasess/items/4248b2dc63a035c2933e
公式な開発は5.3.29で終了しているが、その後Redhatが5.3.3をベースに5.3.3-46のようにメンテナンスを続けていて
2020年11月30日までメンテナンスされる…らしい
よって、セキュリティ的な意味では5.3だからと言ってダメというわけでも無いみたい
AWSのEC2はPHP5.3.29なので、これには当てはまらないかも？
ただしAmazonLinuxの一部としてメンテナンスされているかも？
いずれにせよ、可能ならPHP5.6へバージョンアップすることを推奨